Sujet 4 : Nature des espèces de la niche infectieuse de Colleotrichum gloeosporioides dans la flore naturelle et association avec les autres membres de la communauté fongique associée

Colletotrichum gloeosporioides est un champignon de répartition mondiale avec une affinité pour une énorme diversité d’hôtes. Nos résultats récents montrent que les souches échantillonnées sur ignames en Guadeloupe semblent provenir d’hôtes proches des parcelles cultivées. L’objectif principal de ce stage sera donc d’identifier les espèces de la végétation naturelle qui hébergent Colletotrichum, par des prélèvements sur le terrain (INRA et parcelles proches de Petit Bourg) et mise en culture des souches échantillonnées. En deuxième objectif, il s’agira d’identifier les autres espèces de champignons présents sur la végétation, et se trouvant en association récurrente avec les Colletotrichum.

Méthodologie/ moyens mis en œuvre

- Identification de la végétation naturelle (Basse Terre)

- Prélèvement de feuilles et protocole de mise en culture

- Identification des champignons collectés

- Analyse de présence/absence de Colletotrichum et de son association avec les autres espèces fongiques dans l’environnement

Contact : laurent.penet@antilles.inra.fr