lundi 2 octobre 2017

Sujet 3 : Nature des espèces de la niche infectieuse de Colleotrichum gloeosporioides dans la flore adventice et association avec les autres membres de la communauté fongique associée

Colletotrichum gloeosporioides est un champignon de répartition mondiale avec une affinité pour une énorme diversité d’hôtes. Nos résultats récents montrent que les souches échantillonnées sur ignames en Guadeloupe semblent provenir d’hôtes proches des parcelles cultivées. L’objectif principal de ce stage sera donc d’identifier les espèces de la flore adventice qui hébergent Colletotrichum, par des prélèvements sur le terrain (INRA et parcelles proches de Petit Bourg) et mise en culture des souches échantillonnées. En deuxième objectif, il s’agira d’identifier les autres espèces de champignons présents sur la flore adventice, et se trouvant en association récurrente avec les Colletotrichum.

Méthodologie/ moyens mis en œuvre :
 - Identification de la flore adventice des champs sur Basse Terre, ainsi que des espèces arbustives et les arbres de bordure des parcelles
- Prélèvement de feuilles et protocole de mise en culture
- Identification des champignons collectés
- Analyse de présence/absence de Colletotrichum et de son association avec les autres espèces fongiques dans l’environnement

Contact : laurent.penet@antilles.inra.fr

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