A l'INRA de Guadeloupe, nous travaillons sur la diversité des virus présents dans les
collections d'ignames. Les virus se trouvent normalement sous forme de
particules virales dans les cellules des plantes infectées, mais il existe chez de nombreuses espèces animales et végétales, ce qu'on
appelle des EVE (endogenous viral elements). C'est-à-dire des séquences
virales intégrées dans le génome de la plante.
Nous travaillons sur ces aspects, et sommes amenés à mettre au point des méthodes pour diagnostiquer et caractériser les virus habituels, et les séquences virales intégrées. Pour celà, nous nous posons la question de savoir dans quelle partie de la plante il est préférable de faire des extractions pour ces analyses.
Le travail demandé au stagiaire serait de commencer à répondre à cette question. Les techniques utilisées seront la culture in vitro, l'échantillonnage de parties de plante sur des vitroplants et des plants sevrés, le diagnostic viral par PCR.
Nous travaillons sur ces aspects, et sommes amenés à mettre au point des méthodes pour diagnostiquer et caractériser les virus habituels, et les séquences virales intégrées. Pour celà, nous nous posons la question de savoir dans quelle partie de la plante il est préférable de faire des extractions pour ces analyses.
Le travail demandé au stagiaire serait de commencer à répondre à cette question. Les techniques utilisées seront la culture in vitro, l'échantillonnage de parties de plante sur des vitroplants et des plants sevrés, le diagnostic viral par PCR.
Encadrante : Madame Marie Umber, ingénieure de recherche en virologie, marie.umber@antilles.inra.fr
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